Арахидоновая кислота формулаОсновным субстратом для биосинтеза эйкозаноидов служит арахидоновая кислота, высвобождаемая из фосфолипидов клеточных мембран под действием фосфолипаз. Простагландины (PGs) и тромбоксаны (TXs) образуются под действием циклооксигеназ (СОХ, простагландин-эндопероксидсинтазы, или простагландинсинтазы). СОХ катализируют окисление арахидоновой кислоты, действуя как диоксигеназы и пероксидазы; в качестве промежуточного продукта образуется PGH2, из которого далее при участии группы ферментов разной природы с общим названием простагландинсинтазы образуются PGD2, PGE2, PGF2a, PGI2 и TXA.

Клонировано 2 гена СОХ. СОХ-1 и СОХ-2 обладают близкими ферментативными свойствами, но различаются по регуляции экспрессии и чувствительности к ингибирующему действию нестероидных противовоспалительных лекарств. СОХ-1 — конститутивно экспрессируемый во многих тканях фермент, тогда как СОХ-2 индуцируется при воспалении. Эксперименты с нокаутом соответствующих генов у мыши показали, в частности, что СОХ-2 необходима для оплодотворения и имплантации, а СОХ-1 — для родовой деятельности. Фармакологическая регуляция СОХ с помощью ингибиторов — важная отрасль медицины: ежегодно в мире потребляется около 120 миллиардов таблеток аспирина — неизбирательного ингибитора СОХ.

Лейкотриены (LTs) образуются из арахидоновой кислоты в несколько стадий. Первая стадия включает окисление арахидоновой кислоты до гидропероксиэйкозатетраеновых кислот и последующего образования эпоксидов. Реакции катализируют изозимы группы липооксигеназы, активность которых может быть направлена на положения 5, 8, 12, 15 субстрата в (S)- и (^-ориентации. Затем эпоксид может быть гидролизован гидролазой или конъюгирован (например, с восстановленным глутатионом под действием глутатион S-трансферазы, или лейкотриенсинтазы).